Mehl mit zerbröselter Hefe und Salz in eine Rührschüssel geben. Wasser nach und nach zugeben, mit den Knethaken zu einem glatten Teig verarbeiten. Teig zudecken und gehen lassen.
Butternut halbieren, entkernen, schälen und in dünne Scheiben schneiden. Birne schälen, entkernen und in Scheiben schneiden. Zwiebel in Ringe schneiden, Schinken würfeln.
Backblech einfetten und mehlen. Den Teig ausrollen und mit Crème frâiche bestreichen, salzen, pfeffern und Thymian aufstreuen. Flammkuchen mit Kürbis- und Birnenscheiben, Zwiebelringen, Schinkenwürfeln und Käse belegen, mit Olivenöl beträufeln.
In der vorgeheizten Backröhre bei 200 °C Ober-/Unterhitze auf der 2. Schiene ca. 35 Minuten backen. Mit Schnittlauchröllchen servieren.